[open-bio-info 12] Knoppix for Bio 1.3.0 リリース

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Itoshi NIKAIDO itosh****@nifty*****
2005年 3月 10日 (木) 12:51:04 JST


にかいどう@KNOB Projectです。

お待たせ致しました。

バイオインフォマティクス向けのCD1枚だけで起動できるLinuxディストリビューション
Knoppix for Bio (KNOB, ノブ) 1.3.0をリリースしました。

今回は、Knoppix-jp 3.7をベースとして、

BioRuby 0.6.5
BioPerl 1.4.0
EMBOSS 2.10.0
R 2.0.1 + Bioconductor 1.5
G-language

など、配列解析、系統解析、発現解析などのバイオインフォマティクス系のソフトを収録しています。

また、EMBOSSで、DDBJ/EMBL だけでなく、NCBIの核酸、タンパク質配列もネットワーク越しに
取得して解析ができるようになりました。

KNOBはCDからブートしますので、すでにハードディスクにインストールされているWindowsやLinux
に影響を与えません。また、coLinux を利用すれば、Windows や Linux が動作している上に
KNOBをアプリケーションのように起動して、本物のLinux環境を利用できます。Cygwinでコンパイル
に悩む必要もなくなります。

coLinux上で動作させる場合は以下のサイトが参考になります。
http://unit.aist.go.jp/itri/knoppix/colinux/index.html

KNOB Project は私がひとりで進めているプロジェクトですので、テストが十分でない
場合もあります。お気付きの点があれば、お知らせ下さい。

KNOBの公式サイト
http://knob.sourceforge.jp/

KNOBのダウンロード
http://knob.sourceforge.jp/pub/

--
二階堂愛 <itosh****@users*****>
Knoppix for Bio Project
http://knob.sourceforge.jp/




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