Toshiaki Katayama
ktym****@dbcls*****
2017年 8月 1日 (火) 23:42:56 JST
みなさま ライフサイエンス統合データベースセンター (DBCLS) と バイオサイエンスデータベースセンター (NBDC) の主催する 国際版 BioHackathon 2017（9月9〜16日に開催）ですが、 現在シンポジウムを含め 95 名、ハッカソンでは約 70 名の 参加登録を頂いています。こちら、まだ会場に余裕がありますので、 参加登録期限を *** 8月10日 *** まで延長することになりました。 参加登録ページ： http://2017.biohackathon.org/registration 今回は第10回目ということで、シンポジウムを2日間に拡大し、 東京市ヶ谷の JST サイエンスプラザ (NBDC) にて開催します。 プログラムは近日中に取りまとめますが、現在までに確定した 講演者とタイトルは Wiki でご参照頂けます。 シンポジウムプログラム： http://2017.biohackathon.org/symposium シンポジウム仮タイトル： https://github.com/dbcls/bh17/wiki/Symposium また、メインとなるハッカソンは、いわて東北メディカル・ メガバンク機構（岩手医科大学）のご協力で、9月11日から 会場を盛岡に移し、１週間の合宿形式で開催します。 こちらでは、様々なデータベースを統合的に活用した アプリケーション開発、データ標準化、ワークフロー構築などを 中心に、生物学から医科学まで幅広く取り組む予定です。 お申込み頂いた参加者は随時ウェブサイトに反映していますので 参加者間での積極的なコラボレーションをお願いします。 ハッカソン参加予定リスト： http://2017.biohackathon.org/participants なお、ご多忙の折、１週間もの合宿は難しいという方もあるかと思います。 一部日程でのご参加の場合も部屋割等調整してなんとか対応しますので、 ご興味のある方はぜひ積極的なご参加をお願いいたします。 片山 俊明 ライフサイエンス統合データベースセンター The 10th NBDC/DBCLS BioHackathon -------------------------------- * BioHackathon 2017: http://2017.biohackathon.org/ OVERVIEW -------- The invitational conference BioHackathon 2017 (BH17) will be held in Tokyo and Morioka, Iwate, Japan from Sep 9th to 16th, 2017. NBDC and DBCLS have been organizing annual BioHackathons since 2008, mainly focusing on standardization and interoperability of bioinformatics data and web services for improving integration, preservation and utilization of databases in life sciences. This year, we will host the hackathon in Morioka with a generous support from the Iwate Medical University where our collaborators are conducting a cohort project for Japanese populations. OBJECTIVES ---------- To improve integration and utilization of data, we have chosen the Semantic Web as a key technology during the past BioHackathons. As a result of our community efforts, most of major databases in life sciences became publicly available as RDF resources, e.g, * DNA sequences and annotations: INSDC (DDBJ), Ensembl * Protein sequences and annotations: UniProt * Protein 3D structures: PDB * Chemical substances: PubChem, ChEMBL * Pathways and interactions: Reactome, PSICQUIC * Biomedical databases: ClinVar, ExAC, MedGen * Text resources: MeSH, PubAnnotations * and more ... and, now it is demanded to create applications based on them, while we also continue developing tools, ontologies and RDF data as we have done in the previous BioHackathons. Topics and targets which may be included by this BioHackathon can be found at http://2017.biohackathon.org/hackathon and we are also open to accept any relevant issues which our community currently faces. DATES & VENUE ------------- On the first two days, we will have a extended public symposium for the 10th anniversary in Tokyo. Then we will move to Morioka for software development and discussions for five days. On the last day, we plan to have a session for summarizing a meeting report. Symposium: Sep 9 (Sat) - 10 (Sun) in Tokyo Hackathon: Sep 11 (Mon) - 15 (Fri) in Morioka Writethon: Sep 16 (Sat) in Morioka The hackathon will be took place at the hotel Taikan which is located at the country side of Morioka city where we can stay together and focusing on coding. NOTICES ------- Note that we need to ask your kind understanding for sharing a hotel room with other participants because the venue doesn't have enough single rooms. Also, we'll make announcements and have discussions related to the hackathon on the mailing list at http://groups.google.com/group/biohackathon so if you are new to our BioHackathon, please subscribe to the list. Best Regards, Toshiaki Katayama on behalf of the BioHackathon 2017 organizers http://dbcls.rois.ac.jp/ Database Center for Life Science (DBCLS), Joint Support-Center for Data Science Research, Research Organization of Information and Systems (ROIS)
