Itoshi NIKAIDO
itosh****@nifty*****
2004年 6月 7日 (月) 19:05:49 JST
にかいどうです。 マシンのスペックを教えてください。あと、Knob を立ちあげた段階で どのぐらい memory が残ってますか? On 2004/06/07, at 17:34, Koichi Minamijima wrote: > 南島です。 > #何度もすいません。 > >>> NTFSにデータベースを入れて、blast しまくるという実験もありうると >>> 思いますが、そこまで勇気がないというか、マシンがありません。 > > ウチに、特に使用してなくて、データが壊れても痛くない（HDに逝かれるのは > 痛いですが、） > ＰＣがありますので、やれないこともないと思います。 > できれば数時間以上、あるいは数日働かせっぱなしにしたい所ですが、 > データベースと配列はどんなのを使うと良いでしょうか？ > BLASTだけでそんだけやるとなると相当な数のquery配列が必要になりますよね。 > まあ、その方が、ファイル単位でのread/writeが増えるので実験には適してい > ますが。 > ・・それともそんな長時間かける必要ないでしょうか。 > > アドバイスいただけると助かります。 > _______________________________________________ > Knob-dev mailing list > Knob-****@lists***** > http://lists.sourceforge.jp/mailman/listinfo/knob-dev > > -- Itoshi NIKAIDO, Ph.D. <itoshi dot nikaido at nifty dot com> / http://itoshi.tv/ ruby -rbio -e \ 'n=Bio::Sequence::NA.new("ATTACTCAAAGCCATATTTAAAATATTAAAGCTATTGATCAA");\ puts n.translate.tr!("Q*", "O ")'
