Takuo Yasunaga
yasun****@bio*****
2015年 2月 3日 (火) 18:38:32 JST
Fork木下さん
安永です。
ありがとうございます。
On 2015/02/03 18:02, Teppei Kinoshita wrote:
> eos-documentメンバー各位
>
> 木下 哲平です。お世話になっております。
> 本日、2月3日(火)のEospedia編集内容を報告致します。
>
> 【活動項目】
> (1) PIONEチュートリアル
> (1-1) 基本５
> ・基本５の補足としてルールを分けない方が速くなる例を挙げました。
> （ルール１つ挟んだだけでもかなりのロスがありました）
>
> (1-2) 単粒子解析
> ・応用４にて(1-1)と同様にルールを合わせて速度が改善される様子を
> ログの比較も含めて、記載しました。
> ・Preprocessにて.roiから一気に.padまで作成するようにルールを変更
> -> 以降の処理でもルールをまとめて実行できるようにします。
> -> 但し、現在mrc2Dto3Dにてエラーが起きていますので、
> こちらを解決してからの編集になると思います。
>
> /Eos$ mrc2Dto3D -h
> dyld: Library not loaded: @rpath/libcudart.5.5.dylib
> Referenced from: /Eos/bin/X86MAC64/mrc2Dto3D
> Reason: image not found
> /Eos/bin/mrc2Dto3D: line 110: 44765 Trace/BPT trap: 5 ${EOS_HOME}/bin/${OSTYPE}/${BASENAME} "$@"
これがcudaのインストールが必要になったことによるものです。
少し整理して連絡いたします。
以上です。
>
> ※ .Dependは全て削除できたと思いますので、また別の原因があるかを探っていきます。
>
> 【現在の編集状況と今後の予定(優先降順)】
> チュートリアル: 単粒子解析のMakefileをPIONEで作成する
> PIONEチュートリアル, TIPS: PIONEのメソッド一覧の使用例を挙げる
> PIONE-Webclient: 新しい操作説明となる場合に実行例を追記する
> API説明: 712件
> 英語化: メインページ周り
> FAQ: 随時追記
>
> 【次回の予定】
> mrc2Dto3Dの問題の解決と、PIONEチュートリアルの単粒子解析を引き続き実施します。
>
> 以上、よろしくお願い致します。
>
> 木下 哲平
--
Takuo Yasunaga
Kyushu Institute of Technology
680-4 Kawazu, Iizuka, Fukuoka, 820-8502, JAPAN