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GNS3は、複雑なネットワークトポロジを設計するためのグラフィカルなネットワークシミュレータです。単純なワークステーションからパワフルなCiscoルーターまでの幅広いデバイスの設定とシミュレーションを行うことができます。Dynamips、Pemu/QEMU、Dynagenをベースにしています。

Sweet Home 3D は、インテリアデザイン用のJavaアプリケーションです。エンドユーザが作成した2Dの間取りプランに家具を配置し、3Dでプレビューできます。

Nsは、研究ネットワークをターゲットにした離散事象シミュレータです。 Nsは、TCPシミュレーション、ルーティング、有線および無線(ローカルおよび衛星)ネットワーク上でのマルチキャストプロトコルのためのサポートを提供します。

Logisimは、デジタル論理回路の設計とシミュレーションのための教育用ツールであり、インターフェース、階層回路、ワイヤバンドル、大規模なコンポーネントライブラリを簡単に学ぶことができます。Javaアプリケーションとして、多くのプラットフォーム上で実行することができます。

APBSは、広範囲な長さのスケールの分子溶質間の静電相互作用をを記述する連続体モデルのための、ポアソン・ボルツマン方程式の数値解法のソフトウェアパッケージです。http://apbs.sf.net/

Rigs of Rodsは、精密でユニークなソフトボディの物理エンジンを使用した、運転、飛行、航海が行える様々な車両の3Dシミュレータのゲームです。

SUMOは、主にドイツ航空宇宙センター（DLR）が開発している顕微鏡と継続的な道路交通シミュレーションソフトウェアです。

NETGENは、3D立方体メッシュジェネレータです。STLファイル形式からのConstructive Solid Geometry(CSG) またはBoundary Representation (BRep)手法の入力を受け入れます。

DWSIMはVB.NETで書かれ、先進的な熱力学計算、石油の特性化、完全機能のGUIを介してアクセス可能な仮説コンポーネントユーティリティを備えたオープンソースの化学プロセスシミュレータです。

CEDAR LSは、論理設計の教育や簡単なデジタルデザインをテストに使用できるインタラクティブなデジタル論理シミュレータです。高レベルのコンポーネントとして双方の低レベルの論理ゲートの機能の機能と、またレジスターとZ80マイクロプロセッサーエミュレータも含みます。

Webベースの共同研究ためのぷらっとホームとハイパフォーマンスコンピューティングのインターフェース、仮想研究室を実装するためのツールです。

OpenFVMは、オープンソースの一般的な3次元数値流体力学（CFD）のソルバーであり、LinuxとWindowsで動作します。非等温過度的流動性をシミュレートする非構造有限体積法を使用します。 Gmshを前後の処理で使用しています。