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393 projects in result set
最後更新: 2003-01-04 14:51

SigmaPi Neurosimulator

SigmaPi is a simulator for recurrent neural networks of arbitrary topology. It uses the LSTM neuron model, and implements a training algorithm based on RTRL with some extensions taken from RProp.

最後更新: 2015-08-21 05:46

VarScan

大量並列シーケンスのバリアント検出。1 つのサンプルの SNPs、indels と合意形成の遺伝子型を呼び出します。腫瘍通常ペア、さらに生殖細胞、体、または LOH、として各バリアントを分類、また身体のコピー番号が変更を検出します。

(Machine Translation)
最後更新: 2003-11-25 14:22

RTLab

RTLab is an RTLinux/RTAI-based data acquisition and control application. It is designed to help experimenters design and implement their hard realtime control experiements using higher abstractions than the services offered by RTAI or RTLinux. It is split into two parts. One is a user-space series of C++ classes (written for Qt) which implement a reference application called DAQSystem which is designed to acquire analog input voltage data and display it on the screen. DAQSystem communicates with rtlab.o, the realtime kernel module which is the second part of RTLab. The rtlab.o realtime kernel part is a kernel module that loads into RTLinux or RTAI and is responsible for driving COMEDI hardware for the purposes of data acquisition and realtime control. The module is extensible and features a 'plugin' architecture so that scientists who are savvy C programmers can easily leverage the existing framework for their own custom experiment logic. Experiment logic is specified by writing a kernel modules that gets called back for each scan rtlab.o acquires from the COMEDI hardware. In addition, data visualization and storage facilities exist in user space so that experimenters can instantly see graphical plots of their analog input data as it comes in from the hardware.

(Machine Translation)
最後更新: 2005-08-30 18:10

pyNetConv - Network Conversion tool

Python ライブラリ GML のようなフォーマット Pajek、Cytoscape およびその他の人気のあるグラフで使用されるもののように多くの異なるフォーマットからのネットワークを変換します。また、ネットワークに実験データを統合するためにサポートしています。

(Machine Translation)
最後更新: 2002-03-15 07:35

BioJava

BioJava aims to provide a comprehensive set of Java components for the rapid development of applications in Bioinformatics. It contains interfaces for representing Sequences, Features, and other important bioinformatics concepts. It can also read and write sequence data in a variety of common formats and communicate with Ensembl databases and with DAS and BioCorba servers.

最後更新: 2011-04-07 21:16

JHeatChart

JHeatChart is a one class Java API for generating heat map charts that was created because very few charting APIs seem to contain the facility to create heat maps. It is not a full featured charting API and cannot be used to other charts. The generated charts are created as Java Image objects, which can be incorporated into a GUI or saved to a file.

最後更新: 2018-02-02 17:12

miRprimer

miRprimer ミールに固有のメソッドを使用して microRNAs の PCR の拡大のためのプライマーのデザイン RT qPCR (Balcells、i.、Cirera、s.、大道芸、p. k. (2011 年)。特定および敏感な定量的 RT-PCR 法によって DNA のプライマーとの Mirna の。BMC 製品。11, 70)。プログラムは Ruby で書かれていたし、開発者のソース コードと、.exe ファイルを簡単に使用が利用できます。

(Machine Translation)
最後更新: 2014-04-30 23:36

Pathomx

Pathomx is a workflow-based tool for the analysis of metabolomic and other omics datasets. It is interactive, visual, extensible, intelligent, and free for any use. It lets you dynamically build analysis workflows using the interactive editor. Drag and drop connections between plugin tools to create a complete workflow through which to run your analysis. Data can be loaded and processed automatically, and new approaches tested simply by connecting tools.

(Machine Translation)
最後更新: 2004-09-08 08:40

CARE2X

Care2x (formerly Care 2002) is software for hospitals and health care organizations. It is designed to integrate the different information systems existing in these organizations into a single efficient system. It solves the problems inherent in a network of multiple programs that are incompatible with each other. It can integrate almost any type of services, systems, departments, clinics, processes, data, or communication that exist in a hospital. Its design can even handle non-medical services or functions like security or maintenance. All of its functions can be accessed with a Web browser, and all program modules are processed on the server side.

最後更新: 2018-08-09 00:04

OpenChrom

!OpenChrom はガス ・ クロマトグラフィーおよび質量分析のためのツールです。フォーカスが別の GC/MS システムやベンダーからデータ ファイルを処理します。その機能とアルゴリズムは、Eclipse RCP に基づく柔軟なプラグインのアプローチを使用して拡張できます。

(Machine Translation)
最後更新: 2007-09-26 00:09

RasTop

!RasTop は蛋白質、核酸、人気 Rasmol ソフトウェアに基づいて小分子の可視化分子グラフィック プログラムです。プログラムは、急速な可視化と分子の解析を目指しています。

(Machine Translation)
最後更新: 2012-09-06 12:35

VTD-XML

Virtual Token Descriptor for eXtensible Markup Language (VTD-XML) refers to a collection of efficient XML processing technologies centered around a non-extractive XML parsing technique called Virtual Token Descriptor (VTD). Depending on the perspective, VTD-XML can be viewed as either an XML parser, a native XML indexer or a file format that uses binary data to enhance the text XML, an incremental XML content modifier, an XML slicer/splitter/assembler, or an XML editor/eraser.

(Machine Translation)
最後更新: 2016-05-13 03:12

PDB2PQR

PDB2PQR は静電気学計算連続体の構造を準備する一般的なタスクの多くを自動化するソフトウェアの Python パッケージ PDB 形式でタンパク質ファイル PQR 形式に変換するためのプラットフォームに依存しないユーティリティを提供することです。

(Machine Translation)
最後更新: 2012-07-07 08:55

BioImageXD

!BioImageXD - 多次元、多データ チャネル、顕微鏡から時系列画像データおよび他の情報源の分析、処理および 3 D レンダリングのための無料のオープン ソース ソフトウェア。

(Machine Translation)
最後更新: 2013-11-23 01:03

Abeel Java Toolkit (AJT)

AJT は、いくつかバイオインフォマティクス データ、グラフィック ファイルのエクスポート、GUI ウィジェット、および公式の Java API を追加長い必要があるクラスを処理するための java ユーティリティ クラスのセット。

(Machine Translation)